Tudo começou quando doze médicos recém formados trabalhando na segunda Unidade de Cirurgia de Mulheres da Santa Casa de São Paulo decidiram abrir uma nova unidade para seus pacientes particulares.
E devido a dificuldade de conseguir leitos para seus pacientes surgiu então a idéia de juntos criarem a Casa de Saúde Santa Joana. Em agosto de 1948, aconteceu a primeira adaptação na casa da Rua Tupinambás, já com seu único dono Dr. Eduardo Rahme Amaro. O pequeno castelo com mais de 40 tipos diferentes de rosas pelo jardim deixava de ser residência para ser uma casa de saúde.
Na primeira versão a casa tinha 18 leitos voltados para doentes particulares. O caráter de maternidade foi tomando forma com os anos. Em 1948, a média era de 10 partos por mês. Quarenta e sete anos depois, o Santa Joana concentra cerca de 60% de seu movimento na maternidade e atinge mais de mil partos por mensais.
Na maternidade Santa Joana já nasceram mais de 300 mil bebês, e foram realizadas inúmeras cirurgias.
A Maternidade também virou ponto de encontro de profissionais da área, e assim tomando forma o Centro de Estudos do Santa Joana, que até os dias de hoje destaca-se pela constante reciclagem médica promovendo eventos científicos de alto Nível, em diversas especialidades.
O ritmo de transformação do Santa Joana tomou um forte impulso, há cerca de 25 anos com a entrada dos planos de saúde o Hospital começou a ter mais possibilidades de investir em melhorias, foi nessa época que foi concluída a primeira ampliação do Santa Joana, da casa de flores surgiu um hospital de 80 leitos.
Nesta fase, o Santa Joana fixou sua imagem como hospital que sempre zelou pelo bom atendimento ao paciente, tanto do ponto de vista médico quanto pessoal. Uma nova era iniciou-se, porém, a partir de 1991, com a inauguração de uma nova ala, foi incorporado um prédio de arquitetura arrojada, conforto, hotelaria de primeiro mundo e tecnologia médica de última geração.
A Maternidade Santa Joana foi desenvolvendo inovações até então nunca vistas em toda a rede hospitalar brasileira. Sistema de câmera de TV que liga o berçário aos apartamentos, o sistema multimídia que anuncia os nascimentos, os cursos psicoprofiláticos, entre outras novidades, contribuíram para o diferencial do hospital.
A UTI adulto se destaca por ser especializada em complicações durante a gravidez. A UTI Neonatal ficou conhecida pela confiança e segurança que transmite para os médicos e familiares, tornando-se referência para casos de alto risco. É uma das duas únicas maternidades brasileiras filiadas ao Instituto Vermont, instituição que reúne as 400 melhores unidades neonatais do mundo, além de ser considerada hoje a única UTI Neonatal cinco estrelas do Brasil.
O hospital foi pioneiro no conceito de suítes LDR (Labor Delivery Room). Estas suítes se transformaram em uma das maiores tendências das maternidades modernas, devido ao parto humanizado. Nela, papai e mamãe podem ficar à vontade, pois quando chega a hora do bebê nascer, ela se transforma em uma perfeita sala de parto.
No ano de 2008 a Maternidade Santa Joana foi eleita pelo sexto ano consecutivo a MELHOR MATERNIDADE DO BRASIL.
Mais uma prova de que o Hospital e Maternidade Santa Joana nunca para de crescer, e é um dos mais modernos do País